В 2050 годах одна из крупнейших компаний по производству роботов — «Автоматизированные системы Фаро» — выпускает новую линейку боевых машин. Они обладали продвинутым искусственным интеллектом, умели самовоспроизводиться и использовать ресурсы окружающей среды в качестве топлива.

Из-за ошибки в коде роботы стали неуправляемыми, начав уничтожение всего живого на планете. Война с машинами была проиграна, однако лучшие ученые Земли решили создать еще один ИИ — Гею, которая сможет спустя годы отключить воинственных роботов, использовать технологию клонирования для восстановления человечества и передать им все накопленные знания.

С момента войны прошли сотни лет. По неизвестным причинам Гея не смогла обучить клонов, поэтому люди живут в племенном строе, города заброшены, а любые технологии воспринимаются как дары богов. Смертоносные роботы Фаро отключены, однако появились новые враждебные машины, похожие на животных.

Молодая охотница Элой случайно оказывается в центре тайного конфликта. Всю первую часть она распутывает события прошлого и узнает правду об устройстве современного мира. Главным злодеем Horizon Zero Dawn выступила программа Аид, которая странным образом отделилась от Геи и решила обнулить все живое, запустив старых боевых роботов.

Вторая часть начинается через полгода после победы над Аидом. Элой продолжает искать способ восстановить нормальную жизнь на планете и перенастроить агрессивные машины. Для этого надо найти копию Геи и собрать все функциональные программы.