События Alan Wake 2 происходят спустя 13 лет после финала первой части. Писатель Алан Уэйк всё это время считается пропавшим без вести, и никакой информации о его местонахождении у персонажей игры нет. Город Брайт-Фоллс, впрочем, и без этого привлекает к себе новую порцию внимания: здесь случается череда жестоких ритуальных убийств.

Расследовать преступления в городок отправляется агент ФБР Сага Андерсон. Вскоре она понимает, что каким-то таинственным образом связана с судьбой давно пропавшего Уэйка. Как именно, девушке предстоит выяснить в рамках опасного путешествия по самым тёмным закоулкам Брайт-Фоллс.

Сага — второй играбельный персонаж в Alan Wake 2. По словам творческого руководителя Remedy Сэма Лейка, повествование и геймплей будут поделены между Аланом и агентом ФБР ровно пополам. При этом в некоторых моментах игроки сами смогут переключаться между персонажами.